1、加强农田水利工程的监管工作
(1) 健全其管理体系，使得工程的管理水平有质的飞跃。为达到农田水利工程建设的规划具有合理性、施工质量具有优质性、工程管理具有科学性，应当具备一整套健全的水利工程建设管理体系。同时还必须有一个完整的工程质量监督管理制度，从上到下，齐抓共管，以保证农田水利的质量合格优秀，创造出更多的经济效益和社会效益。(2) 建立并且健全水利工程的规划、审批制度。规划是农田水利工程建设得以实施的基本前提，是保证水利工程建设完满完工、资源得到充分利用的基础依据。因此，需要一整套健全的规划、审批制度，严格按照调查分析、规划申请、审核实施的工作程序，经过县级、市级到省级的层层把关，努力做到工程的规划合理科学。(3) 创建工程施工的准入证制度以及对工程进行监管的制度。施工准入证制度和工程全程监管制度的实施，有利于保证工程的质量，进一步提高资金的使用效益。

2、加强对现有的农田水利工程的使用管理和维护
合格、优质的农田水利工程建设的完成，为农业的可持续发展奠定了几处。可是，农田水利工程应当做到长期充分地发挥其客观的经济效益和社会效益，所以对已有水利工程的使用管理与维护显得极其重要。(1) 工程的安全管理。应当加强宣传《水法》当中的相关内容，以能够做到在防止自然灾害冲击的同时，也能做到水利工程不受极小部分唯利是图的人为破坏。(2) 水利工程的设施管理。对农田水利工程的设施，应当进行等级造册，将其绘制成工程分布图，分类排列。对于重点的水利工程设施应当进行挂牌、由专人进行重点的管理。(3) 先进技术的推广以及先进人才的培养。农田水利工程的建设是效益长期化的工程，因此要求工程建设规划应当具备发展的目光。地方水利行政部门应当加强对管理人员的业务培训，以提高其管理水平。同时也应当加强新技术的推广和应用工作，使得现有的、正在施工的农田水利项目都可以充分地发挥应有的经济效益和社会效益。